كشف الرئيس المصري عبد الفتاح السيسي أننا "اعتقلنا عددا من المتورطين في هجوم الكنيسة يوم امس"، لافتاً إلى أن "الحكومة والبرلمان لا بد أن يتحركا لأن القوانين تكبل القضاء"، مشدداً على أن "البحث جار عن متورطين اثنين في تفجير الكنيسة ولابد من القضاء على الإرهاب بشكل حاسم".
وفي تصريح له خلال مشاركته في جنازة شهداء تفجير الكنيسة البطرسية، اعلن السيسي أن "محمود شفيق محمد مصطفى هو من فجر نفسه داخل الكنيسة البطرسية بحزام ناسف ويبلغ من العمر 22 عاما".