على الرغم من أنّ إحدى ميزات الأمان الأساسية في خدمة واتساب هي دعم التشفير من مستخدم إلى آخر لمنع أي شخص من إعتراض وقراءة الرسائل في منتصف عملية الإرسال، إلّا أنّه يبدو أنّ هذه الميزة ليست بالمستوى التي يُفترض بها أن تكون. فخلال مؤتمر حول الأمن المعلوماتي، كشف الباحثون أنّ هناك العديد من العيوب في واتساب، تسمح بتغيير محتويات رسائل الدردشة لتصبح رسالة مختلفة تماماً في مضمونها. وأوضح الباحثون، أنّ إحدى الثغرات الأمنية التي تمّ إكتشافها سمحت للمتسلل بتغيير طريقة تحديد مرسل الرسالة، وجعلها تبدو وكأنّها جاءت من شخص آخر. وهذا بدوره يمكن أن يؤدي إلى إحداث فوضى لأنه قد يسمح للمتسللين، مع نية خبيثة، بنشر أخبار كاذبة وجعلها تبدو وكأنها تأتي من مصدر موثوق. وتعليقاً على الثغرة قال متحدث بإسم واتساب أنّهم قاموا بمراجعة هذه المشكلة بعناية، واضعين في إعتبارهم المخاوف التي أثارها الباحثون وقاموا بحل تلك المشكلة، حفاظاً على خصوصية التطبيق وحماية للمستخدمين.